公司注册手续费的计算是企业注册过程中非常重要的一部分，通常会包括以下费用：
注册费用：即企业注册所需的各种费用，包括工商局收取的注册费用和代理公司服务费等。工商局注册费用包括营业执照费、组织机构代码证费、税务登记证费等。
代理记账费用：企业注册完成后，需要进行会计核算，对企业的账务进行管理和维护。通常会选择代理记账公司来处理相关工作，因此需要支付代理记账费用。
税务咨询费用：在注册过程中，企业还需要咨询税务方面的问题，包括如何避税、如何申报等。因此，需要支付税务咨询费用。
其他费用：在企业注册过程中，还需要支付其他的相关费用，如律师费、验资费、公证费等。
以上是注册公司所需支付的主要费用，根据不同地区和不同的代理公司，费用也会有所差异。企业可以在选择代理公司时，根据其收费标准进行选择。
通常情况下，代理公司收费方式分为两种，一种是按照固定金额收费，一种是按照注册资本的百分比收费。按照固定金额收费的代理公司通常会将各种费用计入其中，费用明确，但可能不够灵活。按照注册资本的百分比收费的代理公司通常会更加灵活，但费用相对不够明确。
总体而言，企业在选择代理公司时，需要了解代理公司的收费标准，并根据企业实际情况进行选择，以保证费用的合理性和透明性。
